我院肛肠科是上海同济医院肛肠诊疗中心临床协作单位、南京中医院肛肠诊疗中心临床协作单位，特邀原扬州妇幼保健医院肛肠科主任沈常平坐诊，专业诊治各种肛肠常见病和疑难疾病。
妇科是我院重点建设的特色科室之一，科室以“专病专治”为诊疗模式，擅长诊治妇科炎症、宫颈疾病、计划生育、妇科肿瘤、不孕症、内分泌疾病、异常子宫出血等疾病，开展宫腔镜微创手术、腹腔镜下手术(如子宫肌瘤、附件囊肿等)阴式手术子宫脱垂、尿失禁等)。
擅长运用中医辨证施治理论，结合现代先进医疗技水，治疗高血压、糖尿病、支气管哮喘、慢性阻塞性肺病、慢性胃肠病、胃溃疡、慢性肝炎、胆囊炎、风湿痹病、中风后遗症、颈椎腰椎病、妇科、皮肤科等相关疾病。
骨科、手足外科、疼痛科诊疗中心是我院的特色重点建设科室之一，运用低温等离子射频消融术微创治疗腰椎间盘突出症、颈椎间盘突出症。
眼耳诊疗中心是我院特色专科，是上海第二军医大学附属医院耳鼻咽喉专家诊疗基地，上海、扬州专家教授定期坐诊。
消化内科是我院重点建设专科，是江苏省苏北人民医院胃肠外科联盟单位、江苏省苏北人民医院消化内科联盟单位。
眼耳诊疗中心是我院特色专科，是上海第二军医大学附属医院耳鼻咽喉专家诊疗基地，上海、扬州专家教授定期坐诊。
泌尿外科以泌尿系结石微创治疗为特色，率先建立“24小时泌尿系结石急诊绿色通道”，全天候为结石急症患者提供及时高效的诊疗服务。
使用KaVo 3D eXam i独有的软件可以准确而地实现对种植、基台、修复体的设计，帮助种植修复计划的制定和实施。